Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERFP50548 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERFP50548 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms