Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms