Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms