Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms