Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms