Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms