Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPS1P31327 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPS1P31327 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms