Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms