Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms