Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms