Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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