Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms