Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms