Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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