Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms