Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms