Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms