Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL3L1P16619 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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