Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRG2P13727 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms