Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms