Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms