Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms