Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRPRAP08240 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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