Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIC3O95833 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIC3O95833 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms