Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATE1O95260 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATE1O95260 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms