Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN7O94888 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms