Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms