Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GMDSO60547 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms