Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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