Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms