Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3AO14802 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms