Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP17L12C9JPN9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms