Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KLF12Q9Y4X4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms