Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG5Q9UPR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms