Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms