Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms