Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms