Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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