Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms