Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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