Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms