Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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