Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms