Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms