Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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HMG20AQ9NP66 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HMG20AQ9NP66 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HMG20AQ9NP66 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HMG20AQ9NP66 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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