Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms