Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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