Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms