Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms