Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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